För att beviljas formellt erkännande av religiös status i Italien måste organisationen genomgå två steg. Det första steget är en process varigenom den formella enheten som representerar trossamfundet i Italien på nationell nivå får godkännande av inrikesministeriet att bli juridisk person. Sedan inlämnas en ansökan, varpå inrikesministeriet genomför en utredning av sökandens behörighet. Befinns ansökan vara giltig registreras organisationen som ett erkänt trossamfund. När den processen väl är avslutad och inrikesministeriet har beviljat religiöst erkännande, då är det möjligt att ta ytterligare ett steg och börja förhandla fram ett avtal med staten, kallat Intesa. Det är en särskild överenskommelse med staten och är den högsta formen av religiöst erkännande. Scientology-kyrkan har aldrig försökt att få religiöst erkännande genom denna process. Istället är dess religiösa organisationer i Italien registrerade som religiösa ideella organisationer.
Scientology-kyrkans syften och verksamheter har i högsta instans bekräftats vara religiösa till sin natur. Den italienska kassationsdomstolen (landets högsta rätt) fällde ett historiskt utslag i Bandera och andra mot Italien (n.16835/97) i oktober 1997 där Scientology fastslogs vara en religiös bekännelse (vilket innebär att den har ett religiöst syfte och bedriver religiös verksamhet). Domstolen analyserade kriterierna för religionsbestämning, betonade statens plikt att inte göra inskränkningar i religionsfriheten, och drog slutsatsen att Scientology är en religiös bekännelse.
I februari och augusti 1998 skänkte finansministern Scientology-kyrkorna skattefrihet och klassificerade dem som ”religiösa, ideella samfund”.
Scientology-kyrkans religiösa status har även styrkts i många andra rätts- och förvaltningsbeslut i Italien. Detta otvetydiga erkännande som religion bekräftades av Högsta domstolen i ytterligare ett utslag år 2001. Man stödde sig på de rikliga, och nu överväldigande, rättskällor som fastslår att Scientology är ett trossamfund.
”[…] eftersom Scientology-kyrkan har fått erkännande i USA som ett trossamfund borde den ha fått sin religiösa status i Italien erkänd och därmed tillåtits att utöva sin tro och värva nya anhängare […]”
